Como funcionário da Secretaria de Estado da Saúde, recebeu o desafio do então Secretário da pasta, Dr. Eduardo Vital, de administrar o Leprosário de Sergipe. Após este período prestando excelentes serviços, foi convidado pelo Secretário Estadual de Saúde, na época, Dr. José Machado Souza, renomado pediatra, para dirigir a Maternidade Hildete Falcão Batista. Nela, executou sua administração de forma impecável e condizente com a qualidade dos serviços prestados na unidade. Após finalizar sua passagem por lá, foi convidado a fazer parte da equipe do Hospital São Pedro de Alcântara. Iniciou sua trajetória sendo vice-presidente da instituição.
Com o afastamento do então presidente, Carlos Figueiredo Cabral por problemas de saúde, assume a cadeira da presidência. Ao mesmo tempo, a Secretária de Estado da Saúde, Marta Barreto, tendo conhecimento de sua capacidade administrativa indiscutível, fez o convite para dirigir a Maternidade Leonor Barreto Franco. Construída a mais de 5 anos, localizada também em Capela, a mesma foi inaugurada por Manoel e muito bem gerida nos anos na qual ficou à frente. Por problemas de saúde, resolveu então entregar o cargo e continuar apenas no Hospital São Pedro de Alcântara até os dias atuais.